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Text File  |  1995-07-26  |  2KB  |  43 lines
  1. *********************************************
  2. * Serine proteases, V8 family, active sites *
  3. *********************************************
  4.  
  5. A number of prokaroytic proteases  have  been  shown [1,2] to  be evolutionary
  6. related; their catalytic activity is provided by a charge relay system similar
  7. to that of the trypsin family  of  serine proteases but which probably evolved
  8. by independent convergent evolution. The sequence around the residues involved
  9. in  the catalytic  triad (aspartic acid, serine and histidine) are  completely
  10. different from that of the analogous residues  in the trypsin serine proteases
  11. and can be  used as signatures  specific  to  that category of proteases.  The
  12. proteases which are known to belong to this family are listed below.
  13.  
  14.  - Staphylococcus aureus V8 proteinase, which preferentially  cleaves  peptide
  15.    bonds on the carboxyl-terminal side of aspartate and glutamate and which is
  16.    widely used in protein sequencing studies.
  17.  - Bacillus licheniformis glutamate  specific  endopeptidase (GSE) [3],  which
  18.    like V8 cleaves on the carboxyl-terminal  side of acidic residues, but with
  19.    a strong preference for glutamate.
  20.  - Staphylococcus aureus exfoliative  (or epidermolytic)  toxins  A (gene eta)
  21.    and B (gene etb).  These toxins cause impetigous diseases commonly referred
  22.    to as staphylococcal scalded  skin syndrome (SSSS) and  have been shown [1]
  23.    to possess proteolytic activity.
  24.  
  25. -Consensus pattern: [ST]-G-[LIVMFYW](3)-G-x(2)-T-[LIVM]-x-T-x(2)-H
  26.                     [H is the active site residue]
  27. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  28. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  29.  
  30. -Consensus pattern: T-x(2)-G-[NQ]-S-G-S-x-[LIVM]-F
  31.                     [The first S is the active site residue]
  32. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  33. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  34.  
  35. -Last update: June 1992 / First entry.
  36.  
  37. [ 1] Dancer S.J., Garratt R., Saldanha J., Jhoti H., Evans R.
  38.      FEBS Lett. 268:129-132(1990).
  39. [ 2] Bailey C.J., Smith T.P.
  40.      Biochem. J. 269:535-537(1990).
  41. [ 3] Svendsen I., Breddam K.
  42.      Eur. J. Biochem. 204:165-171(1992).
  43.